Церковь в честь святых Апостолов Петра и Павла построена в 1694 г. усердием «служекъ Покровскаго девичьяго монастыря», по благословению митрополита Илариона. Придельный престол в ней в честь Святителя Митрофания, Воронежского чудотворца, устроен в 1845 г. дворянкой Екатериной Петровой.В 1712 году храм был дополнен зимней Никольской церковью. В начале XVII века на месте этого храма стояла деревянная церковь во имя преподобных Зосимы и Савватия Соловецких. Один из приделов каменной Никольской церкви освящен в честь Святого Алексия. Этот факт возможно связать с пребыванием в монастыре Евдокии Лопухиной, бывшей жены Петра I и памятью о казненном царевиче Алексее. Храм имел пристроенную к паперти колокольню, которая также не сохранилась.